本室前身为建立于1992年的脑髓研究室，1995年更名为藏象研究室，2005年科技体制改革后，全所科室重新调整，组建了新的藏象学研究室。

藏象学研究室主要开展藏象学与五运六气理论两方面的研究工作，以传统理论、文献研究方法结合现代研究、临床研究手段，重点开展藏象理论建构、五运六气临床研究，梳理历代名家的理论学说和临证经验，锤炼理论问题，探索中医理论的新思路、新方法，凝练新观点、新成果。

自2005年至今，在藏象学理论与中医学思维研究领域，本室相继主持国家社会科学基金项目等各级课题10余项，出版多部学术专著，研究成果“中医藏象学的核心观念与理论范式研究”曾获2015年度中国中医科学院科学技术奖三等奖。

研究方向：

1、藏象学理论与象思维研究；

2、五运六气理论与应用研究。